Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp1Q00915 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbp1Q00915 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms