Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itga4Q00651 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Itga4Q00651 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms