Protein–RNA interactions for Protein: Q00420

Gabpb1, GA-binding protein subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb1Q00420 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabpb1Q00420 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabpb1Q00420 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms