Protein–RNA interactions for Protein: P98156

Vldlr, Very low-density lipoprotein receptor, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VldlrP98156 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VldlrP98156 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VldlrP98156 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms