Protein–RNA interactions for Protein: P98083

Shc1, SHC-transforming protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shc1P98083 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Shc1P98083 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Shc1P98083 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms