Protein–RNA interactions for Protein: P97952

Scn1b, Sodium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1bP97952 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Scn1bP97952 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Scn1bP97952 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms