Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RptnP97347 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RptnP97347 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RptnP97347 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RptnP97347 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RptnP97347 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RptnP97347 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RptnP97347 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
RptnP97347 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
RptnP97347 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RptnP97347 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RptnP97347 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RptnP97347 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
RptnP97347 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RptnP97347 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RptnP97347 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RptnP97347 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RptnP97347 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RptnP97347 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms