Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Nkx2-3P97334 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nkx2-3P97334 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms