Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ElocP83940 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ElocP83940 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ElocP83940 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ElocP83940 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ElocP83940 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ElocP83940 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ElocP83940 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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