Protein–RNA interactions for Protein: P82976

Gbx1, Homeobox protein GBX-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx1P82976 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gbx1P82976 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gbx1P82976 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms