Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Polr1bP70700 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1bP70700 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms