Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ldb1P70662 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ldb1P70662 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms