Protein–RNA interactions for Protein: P70289

Ptprv, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase V, mousemouse

Predictions only

Length 1,705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprvP70289 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprvP70289 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprvP70289 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprvP70289 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprvP70289 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PtprvP70289 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms