Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Pdlim4P70271 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Pdlim4P70271 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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