Protein–RNA interactions for Protein: P67871

Csnk2b, Casein kinase II subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2bP67871 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Csnk2bP67871 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csnk2bP67871 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms