Protein–RNA interactions for Protein: P63080

Gabrb3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb3P63080 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gabrb3P63080 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gabrb3P63080 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms