Protein–RNA interactions for Protein: P63013

Prrx1, Paired mesoderm homeobox protein 1, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx1P63013 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Prrx1P63013 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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