Protein–RNA interactions for Protein: P62965

Crabp1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crabp1P62965 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Crabp1P62965 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Crabp1P62965 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms