Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Acta2P62737 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Acta2P62737 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms