Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snrpd2P62317 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snrpd2P62317 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms