Protein–RNA interactions for Protein: P61620

Sec61a1, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec61a1P61620 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sec61a1P61620 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sec61a1P61620 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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