Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Taf13P61216 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Taf13P61216 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf13P61216 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Taf13P61216 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms