Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Siah1aP61092 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Siah1aP61092 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms