Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ube2d1P61080 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms