Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pcbp1P60335 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pcbp1P60335 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms