Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tpm2P58774 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tpm2P58774 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms