Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NcstnP57716 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NcstnP57716 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NcstnP57716 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms