Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd38P56528 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd38P56528 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd38P56528 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd38P56528 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms