Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CckbrP56481 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CckbrP56481 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms