Protein–RNA interactions for Protein: P55258

Rab8a, Ras-related protein Rab-8A, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab8aP55258 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rab8aP55258 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms