Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Sh3bp1P55194 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sh3bp1P55194 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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