Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pex2P55098 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pex2P55098 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pex2P55098 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms