Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CtskP55097 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CtskP55097 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CtskP55097 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CtskP55097 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CtskP55097 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms