Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cux1P53564 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cux1P53564 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux1P53564 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux1P53564 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cux1P53564 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cux1P53564 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms