Protein–RNA interactions for Protein: P52955

Lbx1, Transcription factor LBX1, mousemouse

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Length 282 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lbx1P52955 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Lbx1P52955 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lbx1P52955 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lbx1P52955 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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