Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FmodP50608 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FmodP50608 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FmodP50608 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FmodP50608 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
FmodP50608 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FmodP50608 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FmodP50608 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FmodP50608 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FmodP50608 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms