Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
VdrP48281 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
VdrP48281 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
VdrP48281 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
VdrP48281 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
VdrP48281 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
VdrP48281 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VdrP48281 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
VdrP48281 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
VdrP48281 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
VdrP48281 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms