Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msh2P43247 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msh2P43247 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Msh2P43247 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Msh2P43247 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms