Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PtgfrP43117 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PtgfrP43117 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PtgfrP43117 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms