Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pik3caP42337 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pik3caP42337 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms