Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Rpl28P41105 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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