Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syt4P40749 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Syt4P40749 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syt4P40749 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms