Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Traf1P39428 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Traf1P39428 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms