Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Grik2P39087 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Grik2P39087 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms