Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Lig1P37913 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lig1P37913 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lig1P37913 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms