Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab20P35295 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab20P35295 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms