Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Apoc3P33622 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Apoc3P33622 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Apoc3P33622 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Apoc3P33622 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Apoc3P33622 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms