Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxc5P32043 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Hoxc5P32043 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms