Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VtnP29788 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VtnP29788 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VtnP29788 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
VtnP29788 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
VtnP29788 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms