Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Casp1P29452 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Casp1P29452 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Casp1P29452 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms